A partire dal 1991, l'Istituto e Museo di Storia della Scienza prima e il Museo Galileo poi hanno intensificato la produzione di cataloghi delle proprie collezioni. Oltre al catalogo generale del Museo, sono stati dati alle stampe cataloghi scientifici dedicati ai nuclei più rilevanti della collezione di strumentaria. Questi ultimi, curati da grandi studiosi italiani e stranieri, sono pubblicati in lingua inglese. Essi documentano non solo le opere esposte al pubblico, ma anche gli strumenti conservati nei depositi.

Nella serie dei Cataloghi sono finora stati pubblicati i seguenti volumi:

	Galileo and the Measurement of Time: Interactive Area, edited by Filippo Camerota, Giunti, 47 p., ill.
	Galileo e la misura del tempo: sezione interattiva, a cura di F. Camerota, Giunti, 2012, 47 p., ill.
	Museo Galileo: a guide to the treasures of the collection, a cura di F. Camerota, Giunti, 2010, 95 pp., ill.
	Museo Galileo: guida ai tesori della collezione, a cura di F. Camerota, Giunti, 2010, 95 pp., ill.
	Museo Galileo: masterpieces of science, a cura di F. Camerota, Giunti, 2010, 333 pp., ill.
	Museo Galileo: capolavori della scienza, a cura di F. Camerota, Giunti, 2010, 333 pp., ill.
	Oggi scopro... il Museo Galileo di Firenze, Touring junior, 2009, 32 pp., ill.
	Turner A., Catalogue of Sun-dials, Nocturnals and Related Instruments, Giunti, 2007, 176 pp., ill.
	DVD, Multimedia Catalogue, IMSS, 2005.
	DVD, Catalogo Multimediale, IMSS, 2004. Altra edizione: in Storia della Scienza, Roma, Istituto dell'Enciclopedia Italiana, 2004. Esaurito
	Dekker E., Catalogue of Orbs, Spheres, and Globes, Giunti, 2004, 192 pp., ill.
	Van Helden A., Catalogue of early telescopes, Giunti, 1999, 111 pp., ill.
	Hackmann W., Catalogue of Pneumatical Magnetical and Electrical Instruments, Giunti, 1995, 245 pp., ill.
	Brenni P., Catalogue of Mechanical Instruments, Giunti, 1993, 115 pp., ill.
	Turner G.L'E., Catalogue of microscopes, Giunti, 1991, 128 pp., ill.
	Museo di Storia della Scienza. Catalogo, a cura di M. Miniati, Giunti, 1991, 420 pp., ill. Esaurito

Cataloghi di Strumenti

• Zanca A., Le cere e le terrecotte ostetriche del Museo di Storia della Scienza di Firenze, Firenze, Arnaud, 1981, 18 pp., 10 c. di tavv.
• Righini Bonelli M.L., Settle T., The Antique Instruments at the Museum of History of Science in Florence, Firenze, Arnaud, 1978, 170 pp., ill. Esaurito
• Righini Bonelli M.L., Cantù M.C., Gli strumenti antichi al Museo di Storia della Scienza di Firenze, Firenze, Arnaud, 1980 (1. ed. 1973), 154 pp., ill.
• Belloni L., Lo strumentario chirurgico di Giovanni Alessandro Brambilla dopo il ripristino dei danni dell'alluvione del 4 novembre 1966, Firenze, Istituto e Museo di Storia della Scienza, 1971, 28 pp., 31 c. di tav. a colori.
• Righini Bonelli M.L., Il Museo di Storia della Scienza a Firenze, Milano, Electa, 1968, 250 pp., ill. (Gallerie e Musei minori di Firenze). Esaurito
• Catalogo degli strumenti del Museo di Storia della Scienza di Firenze, Firenze, Olschki, 1954, 394 pp., ill. Esaurito
• Catalogo con aggiornamenti. Istituto e Museo di storia delle scienze, Firenze, Olschki, 1952, 127 pp., ill. In testa al front.: 1a esposizione nazionale di storia delle scienze (Firenze, maggio-ottobre 1929). Esaurito